商業ビルの建ち並ぶ六本木の繁華街の一角に位置する。本校は、関連のある教科教室にメディアスペースを併設した「教科センター方式」を採用し、ゆとりの中で、子供達が生きる力を育み、一人一人の能力・適性に応じた教育が実践できる学校づくりを目指した。 　校舎は、正門から続くプロムナードを中心に４つのブロックで構成した。それぞれのブロックごとに機能をまとめ、体育館ブロック、管理・開放ブロック、教室ブロック、特別教室ブロックで構成した。メディアスペースは、様々なグループでの学習や展示が展開出来る空間とした。また、教科教室型の特徴である教室間の移動を教育の一部として捉え、校内全ての場所に掲示や展示などの充実を図った。校務センターや校長室はオープンなつくりとし、教師と生徒のコミュニケーションの醸成を図った。